Những lợi khuẩn chính là những vi khuẩn có lợi, tốt cho đường ruột và chúng sống trong đó. Các vi khuẩn này chống lại sự phá hoại gây nhiễm trùng của các hại khuẩn, virut, ký sinh trùng, nấm … Tuy nhiên lợi khuẩn và hại khuẩn đều bị tiêu diệt bởi thuốc kháng sinh mỗi khi chúng ta bệnh và dùng thuốc điều trị.